MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 4761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	CCG	2	6	523	528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802374
2	NC_008147	CCG	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802374
3	NC_008147	CCA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802374
4	NC_008147	GAC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802374
5	NC_008147	GCC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
6	NC_008147	GCA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802375
7	NC_008147	GCC	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
8	NC_008147	CCA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
9	NC_008147	CCG	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
10	NC_008147	CGC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
11	NC_008147	TCG	2	6	942	947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802375
12	NC_008147	CGG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802375
13	NC_008147	ACC	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
14	NC_008147	GCC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
15	NC_008147	CGC	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
16	NC_008147	CCG	2	6	1105	1110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
17	NC_008147	GCC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802375
18	NC_008147	ACC	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
19	NC_008147	GC	3	6	1181	1186	0 %	0 %	50 %	50 %	108802375
20	NC_008147	CAC	3	9	1220	1228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802375
21	NC_008147	CGG	2	6	1485	1490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
22	NC_008147	GCG	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
23	NC_008147	CGG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802376
24	NC_008147	TCG	2	6	1529	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802376
25	NC_008147	GCAGC	2	10	1581	1590	20 %	0 %	40 %	40 %	108802376
26	NC_008147	GCC	2	6	1595	1600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802376
27	NC_008147	TGG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802376
28	NC_008147	GCA	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802377
29	NC_008147	CAC	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802377
30	NC_008147	TCG	3	9	1931	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
31	NC_008147	CGCC	2	8	1963	1970	0 %	0 %	25 %	75 %	108802377
32	NC_008147	CG	5	10	2005	2014	0 %	0 %	50 %	50 %	108802377
33	NC_008147	GCG	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802377
34	NC_008147	CCGG	2	8	2046	2053	0 %	0 %	50 %	50 %	108802377
35	NC_008147	GGTG	2	8	2085	2092	0 %	25 %	75 %	0 %	108802377
36	NC_008147	GCA	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802377
37	NC_008147	TGGC	2	8	2186	2193	0 %	25 %	50 %	25 %	108802377
38	NC_008147	CTG	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
39	NC_008147	CGT	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
40	NC_008147	CTC	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802377
41	NC_008147	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802377
42	NC_008147	GCT	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802377
43	NC_008147	CGC	2	6	2328	2333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802378
44	NC_008147	GAA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802378
45	NC_008147	CCG	3	9	2366	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802378
46	NC_008147	GA	3	6	2461	2466	50 %	0 %	50 %	0 %	108802378
47	NC_008147	GTC	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802378
48	NC_008147	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802378
49	NC_008147	CTC	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802378
50	NC_008147	GAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802378
51	NC_008147	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802379
52	NC_008147	CGT	3	9	2878	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802379
53	NC_008147	AGC	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802379
54	NC_008147	CAC	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802379
55	NC_008147	CGG	2	6	3098	3103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802379
56	NC_008147	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802379
57	NC_008147	GCT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802379
58	NC_008147	CAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802379
59	NC_008147	TGG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802379
60	NC_008147	GCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802380
61	NC_008147	AGCC	2	8	3242	3249	25 %	0 %	25 %	50 %	108802380
62	NC_008147	GAA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802380
63	NC_008147	CGGGC	2	10	3334	3343	0 %	0 %	60 %	40 %	108802380
64	NC_008147	ACC	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
65	NC_008147	GC	3	6	3381	3386	0 %	0 %	50 %	50 %	108802380
66	NC_008147	TCG	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802380
67	NC_008147	GCC	2	6	3460	3465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802380
68	NC_008147	GCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
69	NC_008147	CGA	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
70	NC_008147	CAT	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802380
71	NC_008147	AC	3	6	3711	3716	50 %	0 %	0 %	50 %	108802380
72	NC_008147	CCA	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
73	NC_008147	CGC	3	9	3799	3807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802380
74	NC_008147	AGC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802380
75	NC_008147	AAC	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802380
76	NC_008147	ACC	2	6	3872	3877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802380
77	NC_008147	TCA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802381
78	NC_008147	GCT	2	6	4365	4370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802381
79	NC_008147	CA	3	6	4371	4376	50 %	0 %	0 %	50 %	108802381
80	NC_008147	CCG	3	9	4428	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
81	NC_008147	GCCG	3	12	4433	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	108802381
82	NC_008147	CGG	2	6	4446	4451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802381
83	NC_008147	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
84	NC_008147	AGC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802381
85	NC_008147	CGG	2	6	4527	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802381
86	NC_008147	TGGG	2	8	4536	4543	0 %	25 %	75 %	0 %	108802381
87	NC_008147	CGC	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
88	NC_008147	CTC	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802381
89	NC_008147	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
90	NC_008147	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
91	NC_008147	GCC	3	9	4687	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802381
92	NC_008147	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802382
93	NC_008147	CCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802382
94	NC_008147	CGA	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802382
95	NC_008147	GGC	3	9	5188	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802382
96	NC_008147	CCGA	2	8	5211	5218	25 %	0 %	25 %	50 %	108802382
97	NC_008147	GTC	3	9	5336	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802382
98	NC_008147	CTC	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802382
99	NC_008147	GTC	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802382
100	NC_008147	GCC	2	6	5460	5465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802382
101	NC_008147	GACC	2	8	5476	5483	25 %	0 %	25 %	50 %	108802382
102	NC_008147	C	6	6	5537	5542	0 %	0 %	0 %	100 %	108802382
103	NC_008147	GCC	2	6	5623	5628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802382
104	NC_008147	ACC	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802382
105	NC_008147	CCG	3	9	6151	6159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
106	NC_008147	CGGT	2	8	6163	6170	0 %	25 %	50 %	25 %	108802383
107	NC_008147	CGA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
108	NC_008147	CAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802383
109	NC_008147	GCCA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	108802383
110	NC_008147	GTG	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802383
111	NC_008147	CCG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
112	NC_008147	CGG	2	6	6331	6336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
113	NC_008147	GAC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
114	NC_008147	CTG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802383
115	NC_008147	GAA	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802383
116	NC_008147	GCC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
117	NC_008147	CGG	2	6	6592	6597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
118	NC_008147	GAC	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802383
119	NC_008147	TGC	2	6	6613	6618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802383
120	NC_008147	GCC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
121	NC_008147	CGC	2	6	6656	6661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802383
122	NC_008147	GTCGT	2	10	6738	6747	0 %	40 %	40 %	20 %	108802383
123	NC_008147	GGC	2	6	6827	6832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802383
124	NC_008147	CGG	3	9	6833	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
125	NC_008147	CGT	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
126	NC_008147	CGG	2	6	6871	6876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
127	NC_008147	CCGG	2	8	6891	6898	0 %	0 %	50 %	50 %	108802384
128	NC_008147	CGC	2	6	6899	6904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802384
129	NC_008147	CGGC	2	8	6925	6932	0 %	0 %	50 %	50 %	108802384
130	NC_008147	GGC	2	6	6977	6982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
131	NC_008147	CGG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
132	NC_008147	CGG	2	6	7016	7021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
133	NC_008147	CGG	2	6	7054	7059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
134	NC_008147	GCG	2	6	7134	7139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
135	NC_008147	GGCT	2	8	7148	7155	0 %	25 %	50 %	25 %	108802384
136	NC_008147	CGG	2	6	7178	7183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802384
137	NC_008147	CTG	2	6	7192	7197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
138	NC_008147	GGT	2	6	7208	7213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802384
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140	NC_008147	TGG	2	6	7261	7266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802384
141	NC_008147	CGCCGG	2	12	7267	7278	0 %	0 %	50 %	50 %	108802384
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143	NC_008147	GCGG	2	8	7293	7300	0 %	0 %	75 %	25 %	108802384
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145	NC_008147	CTG	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802384
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147	NC_008147	CTG	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802385
148	NC_008147	GCG	2	6	7584	7589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
149	NC_008147	GGTA	2	8	7657	7664	25 %	25 %	50 %	0 %	108802385
150	NC_008147	CATG	2	8	7695	7702	25 %	25 %	25 %	25 %	108802385
151	NC_008147	GAG	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802385
152	NC_008147	CGG	2	6	7737	7742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
153	NC_008147	CGA	2	6	7765	7770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802385
154	NC_008147	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802385
155	NC_008147	TGA	2	6	7789	7794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802385
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164	NC_008147	CGA	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802385
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243	NC_008147	ACCCC	2	10	12385	12394	20 %	0 %	0 %	80 %	108802390
244	NC_008147	CCA	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802390
245	NC_008147	GAT	2	6	12475	12480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802390
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249	NC_008147	ACC	2	6	12771	12776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802390
250	NC_008147	TTG	2	6	12797	12802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802390
251	NC_008147	CGG	2	6	12837	12842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802390
252	NC_008147	GCT	2	6	12876	12881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802390
253	NC_008147	TGC	2	6	12937	12942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802390
254	NC_008147	TCC	2	6	13103	13108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802390
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257	NC_008147	ACC	2	6	13182	13187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802390
258	NC_008147	GCC	2	6	13257	13262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802391
259	NC_008147	ACCG	2	8	13277	13284	25 %	0 %	25 %	50 %	108802391
260	NC_008147	GCC	2	6	13337	13342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802391
261	NC_008147	CCACA	2	10	13386	13395	40 %	0 %	0 %	60 %	108802391
262	NC_008147	CGA	2	6	13416	13421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802391
263	NC_008147	TGG	2	6	13456	13461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802391
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265	NC_008147	CGA	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802391
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268	NC_008147	CGA	2	6	13676	13681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802391
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270	NC_008147	CGC	2	6	13713	13718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802391
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278	NC_008147	CGC	2	6	14129	14134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802392
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